RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540438.5

USP28-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 28, humanhuman

TSL 2

Gene USP28, Length 3,015 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP28-208ENST00000540438 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.62□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 ADGRG7Q96K78 797 aa14.62□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.61□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 TREM1Q9NP99 234 aa14.6□□□□□ -0.07
USP28-208ENST00000540438 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
USP28-208ENST00000540438 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USP28-208ENST00000540438 NR2C1P13056 603 aa14.6□□□□□ -0.07
USP28-208ENST00000540438 HIST1H3AP68431 136 aa14.6□□□□□ -0.07
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USP28-208ENST00000540438 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.6□□□□□ -0.07
USP28-208ENST00000540438 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.6□□□□□ -0.07
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