RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518928.1

TSNARE1-203, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-203ENST00000518928 NDUFA2O43678 99 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 PGA5P0DJD9 388 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ARF6P62330 175 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 RELBQ01201 579 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 STUMQ69YW2 141 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 POC1AQ8NBT0 407 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ANGPTL6Q8NI99 470 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ST8SIA4Q92187 359 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ORAI1Q96D31 301 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 BORCS8Q96FH0 119 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 SPACA5Q96QH8 159 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 OR5M11Q96RB7 305 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 PKIBQ9C010 78 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 NLKQ9UBE8 527 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 DHDHQ9UQ10 334 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.65□□□□□ -0.54
TSNARE1-203ENST00000518928 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TOX4O94842 621 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 INMTO95050 263 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 MT-ND2P03891 347 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 PSG2P11465 335 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RBP2P50120 134 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 MTCP1P56278 107 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ERVK11-1P61568 191 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 IL24Q13007 206 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 IKZF1Q13422 519 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 GPR148Q8TDV2 347 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 WDFY2Q96P53 400 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 OPALINQ96PE5 141 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 CHIAQ9BZP6 476 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.64□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A0U1RQK1 487 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 OR2AT4A6NND4 320 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 CLDN34H7C241 214 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RGS10O43665 173 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ALX3O95076 343 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 MELTFP08582 738 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 OCM2P0CE71 109 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 CELP19835 753 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 PRKACBP22694 351 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ATP1B3P54709 279 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TAS2R43P59537 309 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ACSM1Q08AH1 577 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 KLRD1Q13241 179 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF529Q6P280 563 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 PNKDQ8N490 385 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 LHX4Q969G2 390 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TMEM106AQ96A25 262 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SLAMF9Q96A28 289 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RFT1Q96AA3 541 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SPSB1Q96BD6 273 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 GAFA1Q96PS6 74 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF747Q9BV97 191 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 MND1Q9BWT6 205 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 HES4Q9HCC6 221 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RASL12Q9NYN1 266 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 ZNF222Q9UK12 451 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.63□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A1W2PRD5 423 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A1W2PRF3 423 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 A0A1W2PRM7 423 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 WIPF1O43516 503 aa11.62□□□□□ -0.55
TSNARE1-203ENST00000518928 SULT1B1O43704 296 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms