RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2T29Q8NH02 315 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSPH1Q8WYR4 309 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2A7Q96R45 310 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PECRQ9BY49 303 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLE3Q9NRF9 147 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35D1Q9NTN3 355 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLN6Q9NWW5 311 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTOGQ6ZRI0 2925 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP47Q96K76 1375 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.74□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MUC2Q02817 5179 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNA1SQ13698 1873 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 K7EPI3 171 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLOCKO15516 846 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGS5O15539 181 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF737O75373 536 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POP7O75817 140 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOD1P00441 154 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HBE1P02100 147 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSKH1P11801 424 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STMN1P16949 149 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPX2P18283 190 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTFRP26992 372 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMA5P28066 241 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC1A1P43005 524 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBE2HP62256 183 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDK3Q15120 406 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF404Q494X3 552 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM27D1Q5T7N8 215 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM231DQ6ZW35 169 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OLIG3Q7RTU3 272 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8J1Q8NGP2 316 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYPD6BQ8NI32 183 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF426Q9BUY5 554 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GON7Q9BXV9 100 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRRQ9GZT4 340 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED9Q9NWA0 146 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFB11Q9NX14 153 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PISDQ9UG56 409 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTRCQ9Y297 605 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF3AQ9Y496 699 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASB3Q9Y575 518 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CEP170Q5SW79 1584 aa-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHRS12A0PJE2 317 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN11A1L157 253 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5H14A6NHG9 310 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AIM2O14862 343 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A20O43772 301 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DHRS3O75911 302 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT34O76011 436 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOX14O95416 240 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR75O95800 540 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD160O95971 181 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPPAP01160 153 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOCP08134 193 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MLNP12872 115 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IMPA1P29218 277 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL12BP29460 328 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRABP1P29762 137 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSR1P43307 286 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2B8PP59922 312 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB11AP62491 216 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKP2Q13309 424 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSG3Q16557 428 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLLU1OSQ5K130 101 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM215Q68D42 235 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAIR2Q6ISS4 152 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AGTRAPQ6RW13 159 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF283Q8N7M2 679 aa-0.76□□□□□ -2.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LFNGQ8NES3 379 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms