RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa13.66□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 SYT7O43581 403 aa13.66□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.66□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM219Q86XT9 240 aa13.66□□□□□ -0.22
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HERC3-211ENST00000513325 ACTA1P68133 377 aa13.63□□□□□ -0.23
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HERC3-211ENST00000513325 OR5M11Q96RB7 305 aa13.63□□□□□ -0.23
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HERC3-211ENST00000513325 SULT1C4O75897 302 aa13.62□□□□□ -0.23
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HERC3-211ENST00000513325 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
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HERC3-211ENST00000513325 MMP28Q9H239 520 aa13.62□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.62□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 PEX14O75381 377 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 GABRR1P24046 479 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 DUSP1P28562 367 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V1E1P36543 226 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 NPBWR2P48146 333 aa13.61□□□□□ -0.23
HERC3-211ENST00000513325 SLC34A1Q06495 639 aa13.61□□□□□ -0.23
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