RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SNX22	Q96L94	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A0G2JND7	137 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FGF16	O43320	207 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHG2	P01859	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	MPZ	P25189	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A0U1RQV5	110 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMD9	O00233	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	NRAS	P01111	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LYN	P07948	512 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GSTT1	P30711	240 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CBX1	P83916	185 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	NME4	O00746	187 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GSC2	O15499	205 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	NCK1	P16333	377 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PEX2	P28328	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CD34	P28906	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ESRRG	P62508	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FOXE3	Q13461	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	AP4M1	O00189	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TOR1A	O14656	332 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ELANE	P08246	267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GP9	P14770	177 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	MYF6	P23409	242 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	NUDT2	P50583	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	IL24	Q13007	206 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GPR50	Q13585	617 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GRK1	Q15835	563 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RCN3	Q96D15	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PKIB	Q9C010	78 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	IFNG	P01579	166 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	SPN	P16150	400 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM11	P17152	192 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SHOC2-205	ENST00000489390	CDK2	P24941	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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