RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CPT2P23786 658 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TMEM33P57088 247 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 DSCR9P59020 149 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 FGF12P61328 243 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MPPED2Q15777 294 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ZNF404Q494X3 552 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 HES5Q5TA89 166 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 HES4Q9HCC6 221 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 GLS2Q9UI32 602 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ATRQ13535 2644 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 A0A0A6YYH2 397 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 A6NJ64 397 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TMEM178BH3BS89 294 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NDUFS8O00217 210 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 LDLRAD4O15165 306 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA2O43678 99 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NCR1O76036 304 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TPPPO94811 219 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 HPXP02790 462 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 DAOP14920 347 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 IL13RA2Q14627 380 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ARL6IP1Q15041 203 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RAB12Q6IQ22 244 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 OSR2Q8N2R0 312 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 LRRC29Q8WV35 223 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RFT1Q96AA3 541 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TIMD4Q96H15 378 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CHODLQ9H9P2 273 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 HMG20AQ9NP66 347 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CLDN25C9JDP6 229 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 H7C1Q1 480 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SYNGR1O43759 233 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RHBDL1O75783 438 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 NXPH2O95156 264 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 KNG1P01042 644 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 IGKV1D-12P01611 117 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 GLAP06280 429 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CHRM2P08172 466 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 VSIG8P0DPA2 414 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 GLRA1P23415 457 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CDKN1AP38936 164 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 PMELP40967 661 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CAV3P56539 151 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 QRFPP83859 136 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 ZNF146Q15072 292 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MICBQ29980 383 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MPV17LQ2QL34 196 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 Q5PR19 223 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SHEQ5VZ18 495 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 MCFD2Q8NI22 146 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 CCL17Q92583 94 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 RAB1CQ92928 201 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-211ENST00000488243 SLAMF9Q96A28 289 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms