RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TP53I3Q53FA7 332 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IGKV1D-16P01601 117 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SP1P08047 785 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CELA2AP08217 269 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF17P17021 662 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GABRR1P24046 479 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SNCAP37840 140 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FOXL2P58012 376 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LTBQ06643 244 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RNF151Q2KHN1 245 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NRMQ8IXM6 262 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NMES1Q9C002 83 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CBY3A6NI87 242 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CDC42EP2O14613 210 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 WNT11O96014 354 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AMBPP02760 352 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 STATHP02808 62 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF735P0CB33 412 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRSS3P35030 304 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CRMP1Q14194 572 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR8S1Q8NH09 359 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GPX8Q8TED1 209 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 C8orf44Q96CB5 159 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 AQP10Q96PS8 301 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PHB2Q99623 299 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ARHGDIGQ99819 225 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CMC2Q9NRP2 79 aa6.71□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TMEM235A6NFC5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 IFNL4K9M1U5 179 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TGOLN2O43493 480 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CSTAP01040 98 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ELOBQ15370 118 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GUK1Q16774 197 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OPN5Q6U736 354 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 Q6ZRG5 221 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 H0YIZ8 118 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PGA3P0DJD8 388 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EDNRAP25101 427 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ALDH3B1P43353 468 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 FXYD6P3P58550 94 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR2T2Q6IF00 324 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC22A25Q6T423 547 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 VRK2Q86Y07 508 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR52D1Q9H346 318 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 MSGN1A6NI15 193 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 TAAR5O14804 337 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 LMO1P25800 156 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 NTSP30990 170 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OTX2P32243 289 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OPRM1P35372 400 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CX3CR1P49238 355 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SSR4P51571 173 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 SLC16A1P53985 500 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 GFRA1P56159 465 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 HSF1Q00613 529 aa6.7□□□□□ -1.34
USP4-211ENST00000485450 OR5I1Q13606 314 aa6.7□□□□□ -1.34
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