RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 HMG20AQ9NP66 347 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 ADAM30Q9UKF2 790 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.97□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 A0A0A6YYH2 397 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 OOEPA6NGQ2 149 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 A6NJ64 397 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 LGALS8O00214 317 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 CDC14BO60729 498 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 HTR3BO95264 441 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 SFTPBP07988 381 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 VSIG8P0DPA2 414 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 MGMTP16455 207 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 SERPINA2P20848 420 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 GIFP27352 417 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 ZNF146Q15072 292 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 P2RY14Q15391 338 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 MPV17LQ2QL34 196 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 RAB40AQ8WXH6 277 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 YIPF5Q969M3 257 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 TM2D1Q9BX74 207 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 LIME1Q9H400 295 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 IFT22Q9H7X7 185 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.96□□□□□ -0.65
NISCH-208ENST00000481211 CACNA1DQ01668 2161 aa10.96□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 APOA1P02647 267 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CHRM2P08172 466 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 PRKACAP17612 351 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 COL8A2P25067 703 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NPBWR2P48146 333 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ART1P52961 327 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CLDN12P56749 244 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 BTG1P62324 171 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ARL6IP1Q15041 203 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CNPY1Q3B7I2 92 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 UBE2NLQ5JXB2 153 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RAB12Q6IQ22 244 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CHST4Q8NCG5 386 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 MCFD2Q8NI22 146 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NRGNQ92686 78 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 Q96M66 194 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ABCG5Q9H222 651 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NLKQ9UBE8 527 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.95□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 DYSFO75923 2080 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 SH2D1BO14796 132 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 TPPPO94811 219 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 MPIG6BO95866 241 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 GLAP06280 429 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 UNC119Q13432 240 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 SPICQ8N5J4 248 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 FAM46BQ96A09 425 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RHBDL2Q9NX52 303 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 PEX16Q9Y5Y5 336 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CACNG2Q9Y698 323 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NKX6-3A6NJ46 265 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 OR2AT4A6NND4 320 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 PPIHO43447 177 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 SSX4O60224 188 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 NDUFS7O75251 213 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 IGHV2-70P01814 119 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 EGR1P18146 543 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 S100A5P33763 92 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 STUMQ69YW2 141 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-208ENST00000481211 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms