RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PGA3P0DJD8 388 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 IRF1P10914 325 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF708P17019 499 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CEACAM3P40198 252 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 BLKP51451 505 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF616Q08AN1 781 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PMPCAQ10713 525 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SLC17A1Q14916 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CEBPEQ15744 281 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR8S1Q8NH09 359 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RAB8BQ92930 207 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GLYATL1Q969I3 302 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 VPS25Q9BRG1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 S1PR5Q9H228 398 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GPR84Q9NQS5 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CKLFQ9UBR5 152 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SMPXQ9UHP9 88 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPK0 400 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF732B4DXR9 585 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 H0YL77 283 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LATO43561 262 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SOX15O60248 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 YPEL1O60688 119 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TOX4O94842 621 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 NDUFB2O95178 105 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRH1P02810 166 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR4A8P0C604 315 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR13C7P0DN81 318 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CD99P14209 185 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MMP9P14780 707 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TCN2P20062 427 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 BSGP35613 385 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PSMB10P40306 273 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CAPZBP47756 277 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RGRP47804 291 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 EFNA3P52797 238 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PRKAG1P54619 331 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RND3P61587 244 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 COL10A1Q03692 680 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MESP2Q0VG99 397 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 CR1LQ2VPA4 569 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 BSXQ3C1V8 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 LRTM2Q8N967 370 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 SMRP1Q8NCR6 262 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GPR119Q8TDV5 335 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 TSLPQ969D9 159 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZG16BQ96DA0 208 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 YPEL2Q96QA6 119 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 OR5B12Q96R08 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 RNF2Q99496 336 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 GABRG3Q99928 467 aa6.28□□□□□ -1.4
PKP4-211ENST00000481115 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.28□□□□□ -1.4
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