RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 LRRC18Q8N456 261 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 MR1Q95460 341 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC187A0A096LP49 1063 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 A0A1W2PR77 199 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF726A6NNF4 738 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 YKT6O15498 198 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RD3LP0DJH9 198 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 MSX1P28360 303 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ASCL1P50553 236 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 FXYD4P59646 89 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RAB2AP61019 212 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.01□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ST8SIA3O43173 380 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CD38P28907 300 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SFTPDP35247 375 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 TAF9Q16594 264 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HIKESHIQ53FT3 197 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 PYY3Q5JQD4 70 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OR10G3Q8NGC4 313 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OR4D5Q8NGN0 318 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 DYRK2Q92630 601 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 BOD1Q96IK1 185 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CHRDQ9H2X0 955 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SMDT1Q9H4I9 107 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 AQP7P3A6NL99 342 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 LMO7DNF2Z398 122 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 WRBO00258 174 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ANGPTL7O43827 346 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 DTYMKP23919 212 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CLDN17P56750 224 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 GJC3Q8NFK1 279 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OR11L1Q8NGX0 322 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 TGIF2Q9GZN2 237 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 C11orf1Q9H5F2 150 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 GPR173Q9NS66 373 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ZNF727A8MUV8 499 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 DBHP09172 617 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 MSR1P21757 451 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CDPF1Q6NVV7 123 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SPSB3Q6PJ21 355 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 NABP1Q96AH0 204 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 NELFAQ9H3P2 528 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 FGF21Q9NSA1 209 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 MMP24Q9Y5R2 645 aa9□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HAAOP46952 286 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 MTCP1P56278 107 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CARFQ8N187 725 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 OR2M3Q8NG83 312 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 C10orf35Q96D05 121 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 H3BQ15 152 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SLC34A2O95436 690 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HEXBP07686 556 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HIST1H3AP68431 136 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 CHAF1BQ13112 559 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HAGHQ16775 308 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 BRICD5Q6PL45 260 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 LGI3Q8N145 548 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 SLC35G3Q8N808 338 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 RAB39BQ96DA2 213 aa8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
LINC00886-201ENST00000472943 METTL9Q9H1A3 318 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms