RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	NRAS	P01111	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NGF	P01138	241 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SERPINA5	P05154	406 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PRKACB	P22694	351 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GIF	P27352	417 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	WNT5A	P41221	380 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PTGFR	P43088	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	VEGFC	P49767	419 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZP1	P60852	638 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BTG1	P62324	171 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TGFBR3	Q03167	851 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MUC15	Q8N387	334 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	AQP3	Q92482	292 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM168A	Q92567	244 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HPS1	Q92902	700 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BANF2	Q9H503	90 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ALG5	Q9Y673	324 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TCRB	P04435	133 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CELA3B	P08861	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CSF1	P09603	554 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SRD5A1	P18405	259 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PTAFR	P25105	342 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CCR6	P51684	374 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MALL	Q13021	153 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		Q6ZTK2	550 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF525	Q8N782	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CHST4	Q8NCG5	386 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PIGC	Q92535	297 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM235	A6NFC5	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364		E7EQL1	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	LPL	P06858	475 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CHRM2	P08172	466 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	FABP6	P51161	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	FUT6	P51993	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	ATP1B3	P54709	279 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	MTCP1	P56278	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	S100A13	Q99584	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RUBCN-208	ENST00000471364	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68

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