RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 LGALS12Q96DT0 336 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 PELI1Q96FA3 418 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CEP19Q96LK0 163 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1W2PQ09 198 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLC1A7O00341 560 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLC16A6O15403 523 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 PSPNO60542 156 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ALX3O95076 343 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 NXPH2O95156 264 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 IGHA1P01876 353 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CHRM2P08172 466 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 LMO1P25800 156 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 KIR2DS4P43632 304 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 NPBWR2P48146 333 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ODF4Q2M2E3 257 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF529Q6P280 563 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CBR4Q8N4T8 237 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 PP6455Q8WZ26 134 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SSX3Q99909 188 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 H0YAE9 185 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ATF1P18846 271 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 PAX6P26367 422 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 EFNB2P52799 333 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF91Q05481 1191 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 BLMHQ13867 455 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 OR8H2Q8N162 312 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 BATF2Q8N1L9 274 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 Q8N2B8 174 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 APH1BQ8WW43 257 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CFHR4Q92496 578 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLAMF9Q96A28 289 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 RNFT2Q96EX2 444 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SNX22Q96L94 193 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 GNG8Q9UK08 70 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 E9PI62 339 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 H3BSH0 61 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 H3BUX3 64 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ANGPTL7O43827 346 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CHST1O43916 411 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CIB2O75838 187 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 KDM4BO94953 1096 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF728P0DKX0 622 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 BMXP51813 675 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ACTC1P68032 377 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ACTA1P68133 377 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 GALEQ14376 348 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF626Q68DY1 528 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 SYS1Q8N2H4 156 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 Q8NFD4 153 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CORO2AQ92828 525 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 FGGYQ96C11 551 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 JAM3Q9BX67 310 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 HMG20AQ9NP66 347 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 MMP23AO75900 390 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 ZFPL1O95159 310 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CGB3P0DN86 165 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 CGB7P0DN87 165 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-232ENST00000470482 BCL3P20749 454 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms