RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	MUC15	Q8N387	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0A6YYD4	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JMP0	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0X1KG70	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ISPD	A4D126	451 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HS3ST1	O14792	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SYNGR1	O43759	233 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR3B	O95264	441 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FSTL3	O95633	263 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DANCR	P0C864	163 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NPBWR2	P48146	333 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS2R20	P59543	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TESK1	Q15569	626 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MPV17L	Q2QL34	196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PP11	408 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	RHBDL1	O75783	438 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	UPK1B	O75841	260 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	GRP	P07492	148 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL3	P20749	454 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA2	P20848	420 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	VEGFC	P49767	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	PPOX	P50336	477 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF146	Q15072	292 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		Q8N402	240 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	BANF2	Q9H503	90 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		F8VVB4	439 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		F8VWA3	439 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		J3QRK9	145 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRY3	O43610	288 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	CD8A	P01732	235 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	CSF3	P09919	207 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	FUT3	P21217	361 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	LMO1	P25800	156 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	IFITM3	Q01628	133 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	MPPED2	Q15777	294 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	BAK1	Q16611	211 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZTK2	550 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	GPX8	Q8TED1	209 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB3C	Q96E17	227 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TRAF4-208	ENST00000469529		H7C417	338 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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