RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	FGF12	P61328	243 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PPP3R1	P63098	170 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC35A2	P78381	396 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	MED22	Q15528	200 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CD177	Q8N6Q3	437 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	GPER1	Q99527	375 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		Q9H521	79 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	HES4	Q9HCC6	221 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF222	Q9UK12	451 aa		14.7	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	GPR37	O15354	613 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	KNG1	P01042	644 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TMEM225B	P0DP42	221 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	BCL3	P20749	454 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	NPBWR2	P48146	333 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ARF6	P62330	175 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SPHAR	Q15513	63 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	KISS1	Q15726	138 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RNF144B	Q7Z419	303 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		Q8IYB0	196 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DUSP21	Q9H596	190 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		14.69	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPK0	400 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQ09	198 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF879	B4DU55	563 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TOX4	O94842	621 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ALX3	O95076	343 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PRKACA	P17612	351 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CRHBP	P24387	322 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902		Q499Y3	187 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RNLS	Q5VYX0	342 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF561	Q8N587	486 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ORAI1	Q96D31	301 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SDSL	Q96GA7	329 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR14A2	Q96R54	314 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR5M11	Q96RB7	305 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CKLF	Q9UBR5	152 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	NUP50	Q9UKX7	468 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	STAB1	Q9NY15	2570 aa		14.68	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SFTPB	P07988	381 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	HSMCR30	P0CW71	290 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FPR2	P25090	351 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DUSP1	P28562	367 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CAV3	P56539	151 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	COL10A1	Q03692	680 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DOC2B	Q14184	412 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	UPRT	Q96BW1	309 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	WDFY2	Q96P53	400 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		14.67	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RNF212B	A8MTL3	300 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TCF21	O43680	179 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CHRM2	P08172	466 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	BDH1	Q02338	343 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	DDI2	Q5TDH0	399 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TMED9	Q9BVK6	235 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		14.66	□□□□□ -0.06
USP19-210	ENST00000465902	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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