RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 PIGCQ92535 297 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 DYRK2Q92630 601 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM8Q96KF7 97 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 PRRX2Q99811 253 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 LIME1Q9H400 295 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FAM221AA4D161 298 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 JTBO76095 146 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF205O95201 554 aa15.89■□□□□ 0.13
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SYNE4-204ENST00000465425 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SLC22A25Q6T423 547 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRG7Q96K78 797 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 NAA60Q9H7X0 242 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 GPR35Q9HC97 309 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-12P01611 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FCGR2CP31995 323 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CYB561P49447 251 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 MST1LQ2TV78 715 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SP6Q3SY56 376 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM88Q6PEY1 159 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ABHD3Q8WU67 409 aa15.89■□□□□ 0.13
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ARID1AO14497 2285 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO24O75426 580 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SNAPINO95295 136 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 OR5AC1P0C628 307 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TDGF1P13385 188 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 MALLQ13021 153 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SKA3Q8IX90 412 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 WNT2BQ93097 391 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SEC11CQ9BY50 192 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FBXL17Q9UF56 701 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 B4E171 279 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 XRCC2O43543 280 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 NME2P22392 152 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TSPAN7P41732 249 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM33P57088 247 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SPEM2Q0P670 501 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TECTBQ96PL2 329 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 IL36GQ9NZH8 169 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 F10P00742 488 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CAV2P51636 162 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 GALNT14Q96FL9 552 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SYT3Q9BQG1 590 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 DEPPQ9NTK1 212 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CYTIPO60759 359 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PDCD6O75340 191 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 IGHV3-9P01782 118 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 GLP1RP43220 463 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 LPAR6P43657 344 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SULT1A2P50226 295 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CLDN15P56746 228 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM187Q14656 261 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SSPNQ14714 243 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 OR8B8Q15620 311 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 H7C2Y5 167 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 PDCD1Q15116 288 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 E5RGE8 158 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINA7P05543 415 aa15.85■□□□□ 0.13
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