RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 BPIFB3P59826 476 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 Q6YL49 198 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 UTS2BQ765I0 119 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF561Q8N587 486 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 DHRSXQ8N5I4 330 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5D18Q8NGL1 313 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM13Q9H4Q3 707 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 INPP5EQ9NRR6 644 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 KNG1P01042 644 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 GNAO1P09471 354 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CCL3L1P16619 93 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 COMPP49747 757 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM200BQ69YZ2 307 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 PACRGLQ8N7B6 248 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OR5AK2Q8NH90 309 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CHIAQ9BZP6 476 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 H0YAE9 185 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV4-59P01825 116 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TK1P04183 234 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OCM2P0CE71 109 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 RPL31P62899 125 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF273Q14593 569 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC23Q5W5X9 447 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 C3orf56Q8N813 242 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAAF1Q8NEP3 725 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OPALINQ96PE5 141 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CLDN34H7C241 214 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 M0R1W7 72 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV1D-12P01611 117 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 PRKACBP22694 351 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SOX2P48431 317 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 HCP5Q6MZN7 132 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf87Q6PH81 154 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CRIP3Q6Q6R5 217 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 MKXQ8IYA7 352 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 NOX4Q9NPH5 578 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM82A0PJX8 343 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM181BA6NEQ2 426 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 NPFFO15130 113 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 PRKACAP17612 351 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 PAX6P26367 422 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 BLMHQ13867 455 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 COMMD4Q9H0A8 199 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 DHDHQ9UQ10 334 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 MEIOCA2RUB1 952 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM212A6NML5 194 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 K7N7A8 449 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF737O75373 536 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 HAND1O96004 215 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 LALBAP00709 142 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CHRM2P08172 466 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC159P0C7I6 412 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CAPGP40121 348 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 PDZK1IP1Q13113 114 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 LAIR2Q6ISS4 152 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM58AQ8N1B3 248 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 TPRX1Q8N7U7 411 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 C17orf50Q8WW18 174 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 GGHQ92820 318 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 DMRTB1Q96MA1 342 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 JAM3Q9BX67 310 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CHST6Q9GZX3 395 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM96BQ9Y3D0 163 aa19.54■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 XPNPEP2O43895 674 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 DCKP27707 260 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SAA4P35542 130 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 EDDM3BP56851 147 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 IL18R1Q13478 541 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 EDDM3AQ14507 147 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 C11orf42Q8N5U0 333 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD9Q8NE22 299 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52N4Q8NGI2 321 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 OR13C5Q8NGS8 318 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SPSB1Q96BD6 273 aa19.53■□□□□ 0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ORAI1Q96D31 301 aa19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms