RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 IFITM1P13164 125 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GPR183P32249 361 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PDE7AQ13946 482 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS1Q14954 304 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SYT14P1Q58G82 188 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ACOT4Q8N9L9 421 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 LRP12Q9Y561 859 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MPDU1O75352 247 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 PLP2Q04941 152 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 GAGE13Q4V321 117 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 TEX37Q96LM6 180 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC61Q9BV99 259 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 M0R2N6 131 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 PPP2CAP67775 309 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ACVR1Q04771 509 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CHEK1O14757 476 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 SOX8P57073 446 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS3Q14952 304 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 ABCC1P33527 1531 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 A1L4Q6 167 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 H2BFSP57053 126 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 UBE2G1P62253 170 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZVU0 165 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 CLEC3AO75596 197 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FGF1P05230 155 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PGGT1BP53609 377 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SIRPAP78324 504 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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