RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PPT1P50897 306 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BDP58876 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BCP62807 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM209BQ5JX69 171 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 THEM4Q5T1C6 240 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 AVPI1Q5T686 147 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR10AD1Q8NGE0 317 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 SLC34A2O95436 690 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 AARDQ4LEZ3 155 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF429Q86V71 674 aa3.12□□□□□ -1.91
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 DOK5Q9P104 306 aa3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRBP23467 1997 aa3.12□□□□□ -1.91
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