RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412722.1

LINC00427-201, long intergenic non-protein coding RNA 427, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00427, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00427-201ENST00000412722 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 ZFP90Q8TF47 636 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 CPB2Q96IY4 423 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 SLC35E1Q96K37 410 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 MMP26Q9NRE1 261 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 SLC7A10Q9NS82 523 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 CD300AQ9UGN4 299 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.16□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.15□□□□□ -1.9
LINC00427-201ENST00000412722 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CIB4A0PJX0 185 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SYCE1LA8MT33 242 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 FAM166BA8MTA8 275 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HDAC3O15379 428 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 EMC8O43402 210 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 RAD1O60671 282 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 GLAP06280 429 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PGA4P0DJD7 388 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PGA3P0DJD8 388 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ERGP11308 486 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CCL4P13236 92 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CEACAM3P40198 252 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CSNK1A1P48729 337 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CAV2P51636 162 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 MAP3K7CLP57077 242 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HERVK_113P61574 105 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SLC7A9P82251 487 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HERPUD1Q15011 391 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 DUPD1Q68J44 220 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF774Q6NX45 483 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 STPG2Q8N412 459 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 WDR31Q8NA23 367 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CDKL2Q92772 493 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM159Q96B96 161 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR2M2Q96R28 347 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 REEP1Q9H902 201 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SCN8AQ9UQD0 1980 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 D6RAR5 112 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SLC16A7O60669 478 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 RDH16O75452 317 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 TRAPPC6AO75865 159 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CST4P01036 141 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 INSP01308 110 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 FABP3P05413 133 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PGA5P0DJD9 388 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 RAB3AP20336 220 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 FUT3P21217 361 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OMGP23515 440 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 F8A1P23610 371 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ZBTB25P24278 435 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 MYL9P24844 172 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CEACAM6P40199 344 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CDKN2BP42772 138 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PPICP45877 212 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF138P52744 262 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR2B8PP59922 312 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 PPP1CBP62140 327 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HMGCS1Q01581 520 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 STX3Q13277 289 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SYCP1Q15431 976 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 CPTPQ5TA50 214 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF544Q6NX49 715 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SPATA24Q86W54 205 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR2L5Q8NG80 312 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 NTAN1Q96AB6 310 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
LINC00427-201ENST00000412722 SGTBQ96EQ0 304 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms