RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CMC2Q9NRP2 79 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GPR173Q9NS66 373 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 F8VVB4 439 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 F8VWA3 439 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1B1P15313 513 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF3P17036 446 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MPZP25189 248 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HMGA2P52926 109 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PSME3P61289 254 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 BDH1Q02338 343 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ASRGL1Q7L266 308 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 KRT77Q7Z794 578 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SNX22Q96L94 193 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TEAD3Q99594 435 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 FAM206AQ9NX38 181 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 FAM172BPA6NC97 362 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 LEUTXA8MZ59 168 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 M0QZK8 103 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD9O00233 223 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GMNNO75496 209 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB136Q30KP8 78 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PBOV1Q9GZY1 135 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF11BO00300 401 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV1-47P01700 117 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGDIBP52566 201 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HCCSP53701 268 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CBX1P83916 185 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF596Q8TC21 504 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ITFG2Q969R8 447 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CHST6Q9GZX3 395 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MOB4Q9Y3A3 225 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINE3A8MV23 424 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IGHA1P01876 353 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM42Q69YG0 159 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 A6NIN4 97 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ACOD1A6NK06 481 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 KRT36O76013 467 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 INMTO95050 263 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ALOX5APP20292 161 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 PEX2P28328 305 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GDNFP39905 211 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IL24Q13007 206 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 GRK1Q15835 563 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 CITED4Q96RK1 184 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD12-201ENST00000404162 LY6LH3BQJ8 138 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS3O75911 302 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 CCNB2O95067 398 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LY86O95711 162 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35B1P78383 322 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 OR52W1Q6IF63 320 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 COMMD1Q8N668 190 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 C5orf56Q8N8D9 126 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 PKIBQ9C010 78 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 LINC01548A6NM66 108 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD12-201ENST00000404162 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms