RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397787.5

COL18A1-AS1-201, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COL18A1-AS1, Length 3,425 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR8G1Q15617 311 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF429Q86V71 674 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KMT5CQ86Y97 462 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DYRK2Q92630 601 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLAMF6Q96DU3 332 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KLRF1Q9NZS2 232 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LRFN1Q9P244 771 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM24AA6NFZ4 105 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TERTO14746 1132 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TAAR5O14804 337 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IL33O95760 270 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SOD3P08294 240 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CXCL1P09341 107 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCL20P78556 96 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF117Q03924 483 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PLAC9Q5JTB6 97 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C10orf91Q5T1B1 145 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RHBDD2Q6NTF9 364 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LYZL2Q7Z4W2 148 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ARRDC1Q8N5I2 433 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NKAIN3Q8N8D7 197 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR1N1Q8NGS0 311 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RTN4RQ9BZR6 473 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PBOV1Q9GZY1 135 aa12□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ANGPTL7O43827 346 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCL4P13236 92 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EPHA1P21709 976 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CRABP1P29762 137 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RUNX1Q01196 453 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HGFACQ04756 655 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC43A2Q8N370 569 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR10A2Q9H208 303 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DOCK7Q96N67 2140 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SPTBN2O15020 2390 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR5H15A6NDH6 313 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FRG2CA6NGY1 282 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR5H1A6NKK0 313 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CER1O95813 267 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PGA4P0DJD7 388 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PGA5P0DJD9 388 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PTGER4P35408 488 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BIDP55957 195 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 Q8WTZ3 238 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RNF122Q9H9V4 155 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGHV2-5P01817 119 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HLA-HP01893 362 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HOXA5P20719 270 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PPA1Q15181 289 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UBE2V2Q15819 145 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TAF9Q16594 264 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LCN15Q6UWW0 184 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.99□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FCGR2AP12318 317 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FOLR2P14207 255 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RNF4P78317 190 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC31A2O15432 143 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 OR5AC1P0C628 307 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FPR2P25090 351 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SLC26A5P58743 744 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PGAM5Q96HS1 289 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BKO60814 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TMEM127O75204 238 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGKV3-11P04433 115 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BJP06899 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BOP23527 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BBP33778 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BDP58876 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST1H2BCP62807 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.98□□□□□ -0.49
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 POC1AQ8NBT0 407 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms