RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC58Q4VC31 144 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 METTL11BQ5VVY1 283 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ZDHHC22Q8N966 263 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SPSB1Q96BD6 273 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 H0YHG0 523 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SLC1A7O00341 560 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OGG1O15527 345 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ANGPTL7O43827 346 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KNG1P01042 644 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-12P01611 117 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CALCBP10092 127 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 BCL3P20749 454 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CAPZA1P52907 286 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf139Q6ZV77 190 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 STX19Q8N4C7 294 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N7P7 452 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OR5D18Q8NGL1 313 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SGCDQ92629 289 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ORAI1Q96D31 301 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM19Q96E16 107 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R4Q9NYW5 299 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 KPTNQ9Y664 436 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ANK2Q01484 3957 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1B1O43704 296 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OCM2P0CE71 109 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 COL10A1Q03692 680 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PDZK1IP1Q13113 114 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 MED21Q13503 144 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf141Q5SZD1 244 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 GPR157Q5UAW9 335 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SERPINA12Q8IW75 414 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF561Q8N587 486 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 GPR148Q8TDV2 347 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 LHX4Q969G2 390 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PGLYRP3Q96LB9 341 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PQ09 198 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MYL12BO14950 172 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 HCKP08631 526 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MYF6P23409 242 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SNU13P55769 128 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZP1P60852 638 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 KLRD1Q13241 179 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF529Q6P280 563 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 MKXQ8IYA7 352 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 KIR3DL3Q8N743 410 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR5D14Q8NGL3 314 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DUX5Q96PT3 197 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF281Q9Y2X9 895 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM82A0PJX8 343 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF737O75373 536 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 KDM4BO94953 1096 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ALX3O95076 343 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V1G2O95670 118 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TK1P04183 234 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 CDK1P06493 297 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RPSAP08865 295 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PRKACAP17612 351 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP1P28562 367 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 WNT4P56705 351 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD1Q15116 288 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 KISS1Q15726 138 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB112Q30KQ8 113 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 Q8IYB0 196 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 FAM58AQ8N1B3 248 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA3Q8NHX4 192 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 GHSRQ92847 366 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM106AQ96A25 262 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG1-201ENST00000361211 JMJD8Q96S16 334 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms