RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 YIF1AO95070 293 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MPZL1O95297 269 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 QDPRP09417 244 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFB7P17568 137 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 BEND4Q6ZU67 534 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 LYG2Q86SG7 212 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM229BQ8NBD8 167 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 OR13C8Q8NGS7 320 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GPR148Q8TDV2 347 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SEH1LQ96EE3 360 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TDGF1P3P51864 188 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 IL13RA1P78552 427 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MEP1BQ16820 701 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf76Q3KRA6 126 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 AWAT1Q58HT5 328 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C20orf196Q8IYI0 205 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ARRDC1Q8N5I2 433 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FAM24BQ8N5W8 94 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TRIB1Q96RU8 372 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 INTS14Q96SY0 518 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PHB2Q99623 299 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C20orf24Q9BUV8 137 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CST11Q9H112 138 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MFNGO00587 321 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CYB5AP00167 134 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CD5P06127 495 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 VAMP1P23763 118 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB25P24278 435 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 LPAR6P43657 344 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KRTCAP3Q53RY4 240 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CD163Q86VB7 1156 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC26A10Q8NG04 563 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KIRREL1Q96J84 757 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 AMELYQ99218 206 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A7Q99884 636 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CALHM2Q9HA72 323 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C7orf77A4D0Y5 90 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF724A8MTY0 619 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 M0R036 132 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MED6O75586 246 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CRHP06850 196 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ITGA5P08648 1049 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF735P0CB33 412 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FCGR2AP12318 317 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MCEMP1Q8IX19 187 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SECTM1Q8WVN6 248 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FN3KRPQ9HA64 309 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ITPR1Q14643 2758 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 NR2C1P13056 603 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ALOX5APP20292 161 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf170A2RU37 121 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM212A6NML5 194 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINA5P05154 406 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-GP17693 338 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PMELP40967 661 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KIR3DL2P43630 455 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SCAND1P57086 179 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SSX2Q16385 188 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 AKR7LQ8NHP1 331 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MITD1Q8WV92 249 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 FAM3DQ96BQ1 224 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 S100PBPQ96BU1 408 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM8Q96KF7 97 aa17.67■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC31A2O15432 143 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CDAP32320 146 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 WDR38Q5JTN6 314 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 P4HA3Q7Z4N8 544 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ULBP2Q9BZM5 246 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GTF3C1Q12789 2109 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ARG1P05089 322 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GSK3AP49840 483 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM8P78325 824 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 C10orf128Q5T292 105 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A42Q86VD7 318 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 OR4S1Q8NGB4 309 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KCNG2Q9UJ96 466 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 KPTNQ9Y664 436 aa17.66■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MED12LQ86YW9 2145 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms