RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SPSB1Q96BD6 273 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GHITMQ9H3K2 345 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RTTNQ86VV8 2226 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CDC14BO60729 498 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CHRM2P08172 466 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NAAAQ02083 359 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF92Q03936 586 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAM189A2Q15884 450 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM104Q8NE00 496 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0A6YYD4 124 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0A6YYJ9 748 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 INAFM1C9JVW0 142 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 LY6HO94772 140 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RNF170Q96K19 258 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 A0A096LNT2 108 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM235A6NFC5 223 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 AKAIN1P0CW23 69 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CD79AP11912 226 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GTF2F2P13984 249 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 STOMP27105 288 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 VEGFCP49767 419 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RAB1AP62820 205 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GSG1Q2KHT4 349 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 Q6ZTK2 550 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MDP1Q86V88 176 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NPRL2Q8WTW4 380 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NEK6Q9HC98 313 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GPR173Q9NS66 373 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 DNHD1Q96M86 4753 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 PEX14O75381 377 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NDUFB6O95139 128 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MPIG6BO95866 241 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CBR1P16152 277 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 PRKACBP22694 351 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZP1P60852 638 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CDNFQ49AH0 187 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF525Q8N782 197 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CMBLQ96DG6 245 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF75AQ96N20 296 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NICN1Q9BSH3 213 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CST11Q9H112 138 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CA10Q9NS85 328 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MCUBQ9NWR8 336 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CRYAAP02489 173 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R19P59542 299 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ADIPOQQ15848 244 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 A0A1W2PP11 408 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 C5orf49A4QMS7 147 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PRAF2O60831 178 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 NRASP01111 189 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CD3DP04234 171 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 RCVRNP35243 200 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PLP2Q04941 152 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 CHST4Q8NCG5 386 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC6-201ENST00000243108 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms