RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 CALHM2Q9HA72 323 aa18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 FAM60AQ9NP50 221 aa18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.58■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TK1P04183 234 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 MMP9P14780 707 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GNMTQ14749 295 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 C6orf201Q7Z4U5 140 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TMEM242Q9NWH2 141 aa18.58■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 CD55P08174 381 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 FOLR1P15328 257 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ALDH3B1P43353 468 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GPM6BQ13491 265 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ABCA11PQ4W5N1 156 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OR5L1Q8NGL2 311 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 C11orf40Q8WZ69 217 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 CDC14CA4D256 554 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TMEM225BP0DP42 221 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 LBX1P52954 281 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 FXYD4P59646 89 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 RPS21P63220 83 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 C2orf27AQ580R0 203 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OR14C36Q8NHC7 312 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GPR119Q8TDV5 335 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 C18orf12Q96KH6 178 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 CERS4Q9HA82 394 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 H0YIG0 161 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ONECUT2O95948 504 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ZNF17P17021 662 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ZNF43P17038 809 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SLC6A8P48029 635 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 DCAF10Q5QP82 559 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 DNM1P34Q6PK57 102 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 MED29Q9NX70 200 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ZNF319Q9P2F9 582 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GNG13Q9P2W3 67 aa18.57■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OPN1MWP04001 364 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GABRR1P24046 479 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ERVFC1-1P60608 527 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PPA1Q15181 289 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 FAM189A2Q15884 450 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 LIAT1Q6ZQX7 453 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SERPINE3A8MV23 424 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 IFNL4K9M1U5 179 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 NPIPB7O75200 414 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 THEGLP0DJG4 465 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 GP1BBP13224 206 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 EPHA1P21709 976 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PMS2P11Q13670 270 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PRR18Q8N4B5 295 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 VWCEQ96DN2 955 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 DECR2Q9NUI1 292 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.56■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 MSTNO14793 375 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PITX3O75364 302 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 EDN3P14138 238 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 HERPUD1Q15011 391 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ASB10Q8WXI3 467 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SRD5A3Q9H8P0 318 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 H0Y8X5 98 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 RRP8O43159 456 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 ZNF728P0DKX0 622 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 HSF1Q00613 529 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 C1orf189Q5VU69 101 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A26Q70HW3 274 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.55■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 A0A0J9YY10 115 aa18.54■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 HSPA12AO43301 675 aa18.54■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 TUBG1P23258 451 aa18.54■□□□□ 0.56
ODC1-201ENST00000234111 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms