RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ITGA3P26006 1051 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ARL6IP1Q15041 203 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RARRES2Q99969 163 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CHRDQ9H2X0 955 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 NELFAQ9H3P2 528 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 AK3Q9UIJ7 227 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 P2RY1P47900 373 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 LBX1P52954 281 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM187Q14656 261 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA11PQ4W5N1 156 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 FAM213BQ8TBF2 198 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 Q96M66 194 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 BCL2L14Q9BZR8 327 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 OR51M1Q9H341 326 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TUBA4BQ9H853 241 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SDK2Q58EX2 2172 aa23.57■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ECI1P42126 302 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 MTCP1P56278 107 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 OR11L1Q8NGX0 322 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RASL10BQ96S79 203 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF728P0DKX0 622 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SNAI3Q3KNW1 292 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CADM4Q8NFZ8 388 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 HPSE2Q8WWQ2 592 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 GINS3Q9BRX5 216 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CA14Q9ULX7 337 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa23.56■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 GPR37O15354 613 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SCRG1O75711 98 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 NAA60Q9H7X0 242 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TINAGQ9UJW2 476 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 M0R135 149 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CA11O75493 328 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 UCP2P55851 309 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 PPA1Q15181 289 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TSC22D1Q15714 1073 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RTL6Q6ICC9 239 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 OR1J1Q8NGS3 322 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 OR2AE1Q8NHA4 323 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF799Q96GE5 643 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SLC35B3Q9H1N7 401 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ADAMTS20P59510 1910 aa23.55■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 DECR2Q9NUI1 292 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 AP4M1O00189 453 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 GPR137BO60478 399 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 FBXW12Q6X9E4 464 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 NABP1Q96AH0 204 aa23.54■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 COMMD1Q8N668 190 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TCEAL7Q9BRU2 100 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 PNLIPP16233 465 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CEBPGP53567 150 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 PDCD1Q15116 288 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SGK3Q96BR1 496 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 UCN2Q96RP3 112 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RPS23P62266 143 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SLC2A9Q9NRM0 540 aa23.53■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 YIF1AO95070 293 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CCL20P78556 96 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 CLINT1Q14677 625 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 RSU1Q15404 277 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 FADS6Q8N9I5 356 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SLC39A7Q92504 469 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 SLAMF9Q96A28 289 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 MMP24Q9Y5R2 645 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV2-70P01814 119 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 PMELP40967 661 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 NECAP2Q9NVZ3 263 aa23.52■■□□□ 1.36
FAM149A-201ENST00000227065 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 S100PP25815 95 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 RHEBQ15382 184 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 PPIHO43447 177 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 OR2C1O95371 312 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 H3F3AP84243 136 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 METTL9Q9H1A3 318 aa23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF727A8MUV8 499 aa23.5■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 C10orf128Q5T292 105 aa23.5■■□□□ 1.35
FAM149A-201ENST00000227065 SLC22A25Q6T423 547 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms