RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 MARVELD3Q96A59 401 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OMGP23515 440 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 UCP3P55916 312 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 CLDN12P56749 244 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FZD5Q13467 585 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SP1P08047 785 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 KCNMB1Q16558 191 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 WNT2BQ93097 391 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 C1RLQ9NZP8 487 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CEACAM1P13688 526 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HLA-DOBP13765 273 aa5.6□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 NPY4RP50391 375 aa5.6□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 SPINT1O43278 529 aa5.59□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 CSN1S1P47710 185 aa5.59□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 B3GALT4O96024 378 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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SETX-201ENST00000224140 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.59□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.59□□□□□ -1.51
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