RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PCSK4Q6UW60 755 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PP6455Q8WZ26 134 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 DUX4Q9UBX2 424 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 METRNQ9UJH8 293 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF222Q9UK12 451 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ISPDA4D126 451 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 H7C417 338 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MAB21L1Q13394 359 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 IKZF1Q13422 519 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR8B8Q15620 311 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LIME1Q9H400 295 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.61□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 KNG1P01042 644 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 AKR1C4P17516 323 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 VAMP1P23763 118 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 THBS4P35443 961 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 DLX1P56177 255 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZP1P60852 638 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MUCL1Q96DR8 90 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RAB22AQ9UL26 194 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR2AT4A6NND4 320 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HSPB2A8KAH6 182 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PRF1P14222 555 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HSPB2Q16082 182 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MICBQ29980 383 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 AGAP6Q5VW22 663 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RFESDQ8TAC1 157 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SEC22AQ96IW7 307 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 FAM117AQ9C073 453 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PPA2Q9H2U2 334 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 IFT46Q9NQC8 304 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 AK3Q9UIJ7 227 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 JMJD1CQ15652 2540 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR14I1A6ND48 311 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 BET1O15155 118 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV3-15P01624 115 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OMGP23515 440 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00205P59089 165 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 NAAAQ02083 359 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PPA1Q15181 289 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 IGSF11Q5DX21 431 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 GPX8Q8TED1 209 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 FAM122AQ96E09 287 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 GP6Q9HCN6 339 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CA10Q9NS85 328 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 DPRXA6NFQ7 191 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CENPXA8MT69 81 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SSNA1O43805 119 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 TSC22D2O75157 780 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CRYAAP02489 173 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 APOC1P02654 83 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 GABRA1P14867 456 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RPA2P15927 270 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 PITPNAQ00169 270 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 BSPH1Q075Z2 132 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 SP6Q3SY56 376 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 OR2A2Q6IF42 318 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 CST11Q9H112 138 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF69Q9UC07 566 aa5.6□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 DYSFO75923 2080 aa5.59□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.59□□□□□ -1.51
CNIH1-201ENST00000216416 XRCC2O43543 280 aa5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms