RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GNMTQ14749 295 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OPN5Q6U736 354 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DDIT4LQ96D03 193 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FGF21Q9NSA1 209 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 AK3Q9UIJ7 227 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TLCD2A6NGC4 264 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HSPB2A8KAH6 182 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DEDDO75618 318 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGKV3-11P04433 115 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 HSPB2Q16082 182 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 R4GN57 208 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 VAMP2P63027 116 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 RAB39BQ96DA2 213 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.66□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 F10P00742 488 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR2T2Q6IF00 324 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PRR18Q8N4B5 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 NAT6Q93015 286 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GNG13Q9P2W3 67 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 THADAQ6YHU6 1953 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 NPIPB7O75200 414 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CD63P08962 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF17P17021 662 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HAS2Q92819 552 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GNRHR2Q96P88 292 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 AGAP20933 346 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RAB5CP51148 216 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HERV-K104P61576 105 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SNX22Q96L94 193 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTDP1-201ENST00000075430 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TAAR5O14804 337 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 HEXAP06865 529 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 NUDT19A8MXV4 375 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 DLK1P80370 383 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 GPR157Q5UAW9 335 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ST8SIA3O43173 380 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 TBPP20226 339 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 HSD11B2P80365 405 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 RHEBQ15382 184 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTDP1-201ENST00000075430 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.63□□□□□ -0.07
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CTDP1-201ENST00000075430 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 BMP5P22003 454 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ATP6V0CP27449 155 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 PIGCQ92535 297 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 UCN2Q96RP3 112 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 OR51B6Q9H340 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.63□□□□□ -0.07
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