RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HCRTR1O43613 425 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MELTFP08582 738 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BRS3P32247 399 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2FQ969M7 185 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 EMP1P54849 157 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 B2MP61769 119 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HYAL1Q12794 435 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR8B4Q96RC9 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A3O00476 420 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPR3P46089 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CTSCP53634 463 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35B1P78383 322 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HTRA3P83110 453 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLN3Q13286 438 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TEX101Q9BY14 249 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TBX21Q9UL17 535 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GX78 115 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GAGE10A6NGK3 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IDSB3KWA1 339 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 K7EQS6 105 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 AFMIDQ63HM1 303 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF511Q8NB15 262 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LEUTXA8MZ59 168 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DSCR3O14972 297 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DHRS3O75911 302 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR51H1Q8NH63 302 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MVB12AQ96EY5 273 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IL2RAP01589 272 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IL13RA2Q14627 380 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR8G5Q8NG78 346 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CD3DP04234 171 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 Q56UQ5 140 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LIPNQ5VXI9 398 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 STPG3Q8N7X2 389 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf35Q96D05 121 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DERL3Q96Q80 235 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 M0R296 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TNFRSF10CO14798 259 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A1P30531 599 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ERVFRD-1P60508 538 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BTG2P78543 158 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LTC4SQ16873 150 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN23Q96B33 292 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1RLQ9NZP8 487 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DCTDP32321 178 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HRO43593 1189 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SOD3P08294 240 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GNB2P62879 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RND1Q92730 232 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RAXQ9Y2V3 346 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MICBQ29980 383 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GSG1Q2KHT4 349 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RTP2Q5QGT7 225 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM99Q8N816 258 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PSME4Q14997 1843 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HLA-GP17693 338 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.28□□□□□ -1.4
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