RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAC9Q5JTB6 97 aa22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K15Q8NH41 348 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNN3Q9UGI6 736 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC13O75165 2243 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 LCATP04180 440 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-204ENST00000587718 B4GALT1P15291 398 aa21.96■■□□□ 1.11
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