RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 RPP14O95059 124 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CHRM2P08172 466 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCL1P22362 96 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MPZP25189 248 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GABRA5P31644 462 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FUT6P51993 359 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DEFA6Q01524 100 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 Q6ZTK2 550 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 Q8IYB0 196 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PPA2Q9H2U2 334 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR14J1Q9UGF5 321 aa13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PRR32B1ATL7 298 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SYNGR1O43759 233 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TK1P04183 234 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 Q6ZSR3 168 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PP6455Q8WZ26 134 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 BORCS8Q96FH0 119 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NEK6Q9HC98 313 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GLS2Q9UI32 602 aa13.56□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 H3BUX3 64 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RBP4P02753 201 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TFF1P04155 84 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RPSAP08865 295 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OCM2P0CE71 109 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ACTC1P68032 377 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ACTA1P68133 377 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DMRTC1Q5HYR2 192 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CATSPERDQ86XM0 798 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MKXQ8IYA7 352 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CD177Q8N6Q3 437 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CEP19Q96LK0 163 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TBX5Q99593 518 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CIB1Q99828 191 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GABARAPL3Q9BY60 117 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 HES4Q9HCC6 221 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa13.55□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1B0GTI1 187 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 K7N7A8 449 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM244Q5VVB8 128 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ASPHD2Q6ICH7 369 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PNKDQ8N490 385 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 OR4M1Q8NGD0 313 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF488Q96MN9 340 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CHST5Q9GZS9 411 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ABCB10Q9NRK6 738 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 hADV38S2A0JD32 116 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 M0R129 80 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 EPHA2P29317 976 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 KIR2DS4P43632 304 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RBP2P50120 134 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ATP1B3P54709 279 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 EDDM3BP56851 147 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ODF4Q2M2E3 257 aa13.53□□□□□ -0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms