RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565987.5

NUBP2-208, Transcript of nucleotide binding protein 2, human

TSL 5 BASIC

Gene NUBP2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBP2-208	ENST00000565987	CDC42	P60953	191 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF85	Q03923	595 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	BLMH	Q13867	455 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	UBE2V2	Q15819	145 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	FBLN7	Q53RD9	439 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	C1QL4	Q86Z23	238 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF561	Q8N587	486 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RFK	Q969G6	155 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	GNG8	Q9UK08	70 aa		12.88	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		H3BNX3	289 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC1A7	O00341	560 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	EI24	O14681	340 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ANGPTL7	O43827	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	SULT1C4	O75897	302 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PAH	P00439	452 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ALPL	P05186	524 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	KIR3DL2	P43630	455 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	KRTAP10-3	P60369	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ISL1	P61371	349 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ERVK11-1	P61568	191 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	TMED1	Q13445	227 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	TP53I3	Q53FA7	332 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	LINC01006	Q8NI28	216 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	C17orf50	Q8WW18	174 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PKIB	Q9C010	78 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	7e-7	■■□□□ 12.2
NUBP2-208	ENST00000565987	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		12.87	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		F8VVB4	439 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		F8VWA3	439 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		M0QZ24	198 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ENTPD6	O75354	484 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ERVFRD-1	P60508	538 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	IL24	Q13007	206 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	BRICD5	Q6PL45	260 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		Q6ZSV7	163 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RDH10	Q8IZV5	341 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ADI1	Q9BV57	179 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	USE1	Q9NZ43	259 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RNF114	Q9Y508	228 aa		12.86	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	BTBD17	A6NE02	478 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	INMT	O95050	263 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	TK1	P04183	234 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CCL3L1	P16619	93 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PAX6	P26367	422 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	COL10A1	Q03692	680 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ZNF273	Q14593	569 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	SLAMF9	Q96A28	289 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	AJUBA	Q96IF1	538 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CITED1	Q99966	193 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CHST5	Q9GZS9	411 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	AASS	Q9UDR5	926 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.85	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		E9PQ18	207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		J3QRE1	110 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ALDH3A2	P51648	485 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	FUT6	P51993	359 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	PROK1	P58294	105 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	CEP19	Q96LK0	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	MBOAT4	Q96T53	435 aa		12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
NUBP2-208	ENST00000565987		A0A1W2PPH5	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
NUBP2-208	ENST00000565987	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms