RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564582.2

CHD9-210, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, human

TSL 3

Gene CHD9, Length 968 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD9-210	ENST00000564582	PAX5	Q02548	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	BAX	Q07812	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SKP2	Q13309	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	COX19	Q49B96	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MMP21	Q8N119	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ALG14	Q96F25	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	GFI1	Q99684	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582		A0A1W2PPK0	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582		A8MXE2	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF264	O43296	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	DHH	O43323	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	GJB3	O75712	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TBX18	O95935	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	MAS1	P04201	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	QDPR	P09417	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CEACAM1	P13688	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ADRA2C	P18825	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ALOX5AP	P20292	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CASP6	P55212	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TMEM33	P57088	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ID2	Q02363	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TLE2	Q04725	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	SGCG	Q13326	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	RUNX2	Q13950	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	RAB35	Q15286	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	OR7A5	Q15622	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD9-210	ENST00000564582	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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