RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558970.2

GABPB1-208, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, human

TSL 5

Gene GABPB1, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABPB1-208	ENST00000558970	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970		H7C1Q1	480 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	AIRE	O43918	545 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC25A16	P16260	332 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	GIF	P27352	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IL2RG	P31785	369 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	OR10A3	P58181	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ZP1	P60852	638 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IL24	Q13007	206 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MKX	Q8IYA7	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ALX3	O95076	343 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	HTR3B	O95264	441 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	LHB	P01229	141 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PRKACA	P17612	351 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SERPINA2	P20848	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MPZ	P25189	248 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUSP1	P28562	367 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	GABRA2	P47869	451 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ALDH3B2	P48448	385 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CAV3	P56539	151 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	P2RY14	Q15391	338 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	RSU1	Q15404	277 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MICB	Q29980	383 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	HES5	Q5TA89	166 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	S100A13	Q99584	98 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	GFI1	Q99684	422 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970		A0A1B0GW55	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970		A0A1W2PP11	408 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	LGALS8	O00214	317 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	ALDOB	P05062	364 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SFTPB	P07988	381 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SDC2	P34741	201 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PTGFR	P43088	359 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	CLDN12	P56749	244 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	VBP1	P61758	197 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	NCS1	P62166	190 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	PDCD1	Q15116	288 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GABPB1-208	ENST00000558970	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.4	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms