RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF728	P0DKX0	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB25	P24278	435 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OPRM1	P35372	400 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM3A	P98173	230 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF774	Q6NX45	483 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		R4GN57	208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SH2D1B	O14796	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LANCL1	O43813	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RAB1A	P62820	205 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR8S1	Q8NH09	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	EHF	Q9NZC4	300 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DKK4	Q9UBT3	224 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GPR137B	O60478	399 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CD79A	P11912	226 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MAGEA5	P43359	124 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PRDX4	Q13162	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GALNT14	Q96FL9	552 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	STARD10	Q9Y365	291 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	BCL2L11	O43521	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	B4GALT1	P15291	398 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TIMP3	P35625	211 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	HMGN3	Q15651	99 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LPAL2	Q16609	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SKA3	Q8IX90	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KIRREL1	Q96J84	757 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KLK13	Q9UKR3	277 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		B9A039	149 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF735	P0CB33	412 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SERPINA2	P20848	420 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CHAT	P28329	748 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KIR2DS2	P43631	304 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF81	P51508	661 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	STPG2	Q8N412	459 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB124	Q8NES8	71 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DEPP	Q9NTK1	212 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		U3KQ87	197 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MED6	O75586	246 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CDS2	O95674	445 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GPANK1	O95872	356 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CELA2A	P08217	269 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LYL1	P12980	280 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ABO	P16442	354 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PAX5	Q02548	391 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	UNC119	Q13432	240 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SPINK14	Q6IE38	97 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PIGC	Q92535	297 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MFF	Q9GZY8	342 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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