RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	OCM2	P0CE71	109 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PGA5	P0DJD9	388 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PSG2	P11465	335 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF12	P17014	697 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ADRA2C	P18825	462 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GLRA1	P23415	457 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DUSP1	P28562	367 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RBP2	P50120	134 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ERVK11-1	P61568	191 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PAX2	Q02962	417 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IKZF1	Q13422	519 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MED21	Q13503	144 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DGUOK	Q16854	277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CR1L	Q2VPA4	569 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	STUM	Q69YW2	141 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM166A	Q6J272	317 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF529	Q6P280	563 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	UTS2B	Q765I0	119 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF573	Q86YE8	665 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CD177	Q8N6Q3	437 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GPR148	Q8TDV2	347 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PP6455	Q8WZ26	134 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM106A	Q96A25	262 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	BORCS8	Q96FH0	119 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR14A2	Q96R54	314 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMED9	Q9BVK6	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MND1	Q9BWT6	205 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ABCB9	Q9NP78	766 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OPN4	Q9UHM6	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CUBN	O60494	3623 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR2AT4	A6NND4	320 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	C22orf46	C9J442	243 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778		J3QT63	122 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SULT1B1	O43704	296 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CRLF1	O75462	422 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FSTL3	O95633	263 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SFTPB	P07988	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	BCL3	P20749	454 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MPZ	P25189	248 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GABRA2	P47869	451 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PITPNB	P48739	271 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	POU3F4	P49335	361 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ATP1B3	P54709	279 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GNB2	P62879	340 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PDCD1	Q15116	288 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	KISS1	Q15726	138 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MICB	Q29980	383 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SATL1	Q86VE3	508 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SPART	Q8N0X7	666 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	POC1A	Q8NBT0	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ITFG2	Q969R8	447 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	C10orf35	Q96D05	121 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CYYR1	Q96J86	154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OPALIN	Q96PE5	141 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	GAFA1	Q96PS6	74 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	NLK	Q9UBE8	527 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MIOX	Q9UGB7	285 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF222	Q9UK12	451 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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