RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PERP	Q96FX8	193 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GLS2	Q9UI32	602 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SSX4	O60224	188 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MPIG6B	O95866	241 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CALCB	P10092	127 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GTF2F2	P13984	249 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PRKACA	P17612	351 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BCL3	P20749	454 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CFP	P27918	469 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PDLIM4	P50479	330 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SCAND1	P57086	179 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	AKAP6	Q13023	2319 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FAM189A2	Q15884	450 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OSR2	Q8N2R0	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PHF21A	Q96BD5	680 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	IL36G	Q9NZH8	169 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ISPD	A4D126	451 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RGS5	O15539	181 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFS7	O75251	213 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LY6H	O94772	140 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CD80	P33681	288 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CFHR2	P36980	270 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	MICB	Q29980	383 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RAB1C	Q92928	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0B4J203	849 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM178B	H3BS89	294 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CD37	P11049	281 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PAX1	P15863	534 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	MGMT	P16455	207 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	COL8A2	P25067	703 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	PMEL	P40967	661 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	NPBWR2	P48146	333 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	FGF12	P61328	243 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF404	Q494X3	552 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDB1-223	ENST00000543658	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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