RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542416.1

UBC-211, Transcript of ubiquitin C, humanhuman

TSL 4

Gene UBC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBC-211ENST00000542416 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.16□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.16□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.16□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 COL7A1Q02388 2944 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DLGAP1O14490 977 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 PRODHO43272 600 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OR2F2O95006 317 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 PRDX6P30041 224 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 EDDM3BP56851 147 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ACTA2P62736 377 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ACTG2P63267 376 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ACTC1P68032 377 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ACTA1P68133 377 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 CBX1P83916 185 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DGCR2P98153 550 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DOC2BQ14184 412 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 GK3PQ14409 553 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 SPATS1Q496A3 300 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OR52W1Q6IF63 320 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 CGB2Q6NT52 195 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OSR2Q8N2R0 312 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 MROQ9BYG7 248 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 HES4Q9HCC6 221 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DPM3Q9P2X0 92 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 GLS2Q9UI32 602 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
UBC-211ENST00000542416 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 FAM183AA6NL82 134 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ZNF254O75437 659 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 DHRS3O75911 302 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SOX14O95416 240 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 LPLP06858 475 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 MPZP25189 248 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 MYCNOSP40205 109 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 MICAQ29983 383 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 OR8H2Q8N162 312 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 RNF148Q8N7C7 305 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ZNF596Q8TC21 504 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SNX22Q96L94 193 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SLC25A33Q9BSK2 321 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 TEX12Q9BXU0 123 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PKIBQ9C010 78 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 GPR84Q9NQS5 396 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ZFP57Q9NU63 452 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 VNN3Q9NY84 501 aa7.14□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PSMB11A5LHX3 300 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 LEUTXA8MZ59 168 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 H3BN98 237 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ARPC2O15144 300 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SELENOFO60613 162 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ZNF737O75373 536 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 HMGN1P05114 100 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ALOX5APP20292 161 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 PEX2P28328 305 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 CEACAM3P40198 252 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 THBS3P49746 956 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ACTR3P61158 418 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ERVK11-1P61568 191 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 BDH1Q02338 343 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 IL24Q13007 206 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 TMEM42Q69YG0 159 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ASRGL1Q7L266 308 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.13□□□□□ -1.27
UBC-211ENST00000542416 COMMD1Q8N668 190 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms