RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 OOEPA6NGQ2 149 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 BIN3Q9NQY0 253 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.35□□□□□ -1.07
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