RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHST4Q8NCG5 386 aa7.19□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM104Q8NE00 496 aa7.19□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.18□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCG5Q9H222 651 aa7.18□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMG20AQ9NP66 347 aa7.18□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERVK11-1P61568 191 aa7.17□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCD1Q15116 288 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CARTPTQ16568 116 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAF9Q16594 264 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGYQ3MUY2 71 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.17□□□□□ -1.26
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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