RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	BAALC	Q8WXS3	180 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RCN3	Q96D15	328 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PXMP2	Q9NR77	195 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NAGK	Q9UJ70	344 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM131	Q92545	1883 aa		0.39	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	AK9	Q5TCS8	1911 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	KNCN	A6PVL3	124 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	C17orf98	A8MV24	154 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NDUFS5	O43920	106 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	FCN3	O75636	299 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	UPK1B	O75841	260 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	HLA-H	P01893	362 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	KRT16	P08779	473 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GZMB	P10144	247 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PAX6	P26367	422 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEA3	P43357	314 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RAB11A	P62491	216 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	BCL2A1	Q16548	175 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	LRRC66	Q68CR7	880 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SCX	Q7RTU7	201 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SPACA5	Q96QH8	159 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SRR	Q9GZT4	340 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RHOF	Q9HBH0	211 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	FAM206A	Q9NX38	181 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TAC3	Q9UHF0	121 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SLIT2	O94813	1529 aa		0.38	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ERICH4	A6NGS2	130 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		J3QT63	122 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	DHRS3	O75911	302 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RHOC	P08134	193 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PYCR3	Q53H96	274 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SCD5	Q86SK9	330 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF738	Q8NE65	137 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RASD2	Q96D21	266 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GABRG3	Q99928	467 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MCUB	Q9NWR8	336 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		0.37	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ODF3B	A8MYP8	253 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760		F5H5T6	163 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	UPK1A	O00322	258 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OR2A4	O95047	310 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PSMB9	P28065	219 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	C21orf59	P57076	290 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SLC35A1	P78382	337 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	PMVK	Q15126	192 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TNXA	Q16473	311 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	RPEL1	Q2QD12	228 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	DAW1	Q8N136	415 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ITFG1	Q8TB96	612 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	DCANP1	Q8TF63	244 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MAL2	Q969L2	176 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	TPD52L3	Q96J77	140 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	GSDMA	Q96QA5	445 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	OR2A7	Q96R45	310 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
CDK1-208	ENST00000519760	AICDA	Q9GZX7	198 aa		0.36	□□□□□ -2.35

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