RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CGB1A6NKQ9 187 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFPL4AA6NLU0 287 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CENPBD1B2RD01 187 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPIPB6E9PJ23 425 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QR06 171 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLPP3O14495 311 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DYNC1I1O14576 645 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBFA2T2O43439 604 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSCAO43653 123 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDH3BO43837 385 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPIPB7O75200 414 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HAND1O96004 215 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TK1P04183 234 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENO1P06733 434 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DBIP07108 87 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPART-AS1P0CW21 52 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR2F1P10589 423 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLUP10909 449 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DBTP11182 482 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSG2P11465 335 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLNP12872 115 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOLR2P14207 255 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACADSP16219 412 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BGNP21810 368 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AADACP22760 399 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HPCAL1P37235 193 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELLP55199 621 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERVK11-1P61568 191 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS26P62854 115 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AESQ08117 197 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MADCAM1Q13477 382 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNX1Q13596 522 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EDDM3AQ14507 147 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNCBQ16143 134 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR4Q16378 134 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC18A3Q16572 532 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-DRB5Q30154 266 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM21Q3B7S5 101 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM30BQ3MIR4 351 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGTA1PQ4G0N0 100 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTBL2Q562R1 376 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALG10BQ5I7T1 473 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM69Q5SWH9 247 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf128Q5T292 105 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MROH9Q5TGP6 573 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AGBL2Q5U5Z8 902 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM71E1Q6IPT2 247 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC27Q6P3X3 843 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLC3Q6P597 504 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC2A7Q6PXP3 512 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL34Q6ZMJ4 242 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSX7Q7RTT5 188 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCXQ7RTU7 201 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRUNE1Q86TP1 453 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANGPTL5Q86XS5 388 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PEX5LQ8IYB4 626 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM61Q8N0U2 210 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGAP24Q8N264 748 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBL4BQ8N7F7 174 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8N9W7 124 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX45Q8NA69 505 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB561A3Q8NBI2 242 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM156AQ8NDB6 213 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4F6Q8NGB9 312 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR8B12Q8NGG6 310 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4D6Q8NGJ1 314 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10X1Q8NGY0 326 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2T11Q8NH01 316 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5J2Q8NH18 312 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5AK3PQ8NH89 298 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1F12Q8NHA8 337 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF671Q8TAW3 534 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FNDC8Q8TC99 324 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 XAGE5Q8WWM1 108 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ROPN1LQ96C74 230 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LGALS12Q96DT0 336 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 APIPQ96GX9 242 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX37Q96LM6 180 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 S1PR3Q99500 378 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRIP2Q9BQI9 281 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAT9Q9BTE0 207 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTL8AQ9BWD3 113 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 REEP4Q9H6H4 257 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPA3Q9H6K4 179 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GORASP2Q9H8Y8 452 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRD7Q9NPI1 651 aa1.33□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms