RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513274.5

COPB2-211, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPB2, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-211ENST00000513274 TBX5Q99593 518 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MMP28Q9H239 520 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ZNF702PQ9H963 129 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 RAB18Q9NP72 206 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 USE1Q9NZ43 259 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.27□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A0A1B0GTI1 187 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A0A1W2PPE2 198 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A0A1W2PR64 198 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A0A1W2PRV1 198 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 AQP12BA6NM10 295 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 F8VVB4 439 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 F8VWA3 439 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FKBP6O75344 327 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FBXO24O75426 580 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ZNF254O75437 659 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FAM107AO95990 144 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 DAPP51397 102 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ROM1Q03395 351 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FBLN7Q53RD9 439 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZS46 218 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 KRT74Q7RTS7 529 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 R3HDM4Q96D70 268 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.26□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A0A1W2PRX2 142 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 DLGAP1O14490 977 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 PEX14O75381 377 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CALCBP10092 127 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 DLX6P56179 175 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FLOT2Q14254 428 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 EDDM3AQ14507 147 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 AANATQ16613 207 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 C11orf88Q6PI97 169 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 Q6ZPA2 131 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MRAPQ8TCY5 172 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SGCDQ92629 289 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SLAMF9Q96A28 289 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 NRIP2Q9BQI9 281 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 R4GMQ9 66 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 V9GYS6 101 aa9.25□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 A6NDX4 124 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 C17orf98A8MV24 154 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 K7N7A8 449 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 APOL3O95236 402 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ZNF728P0DKX0 622 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 EPHA2P29317 976 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 BLCAPP62952 87 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TMEM42Q69YG0 159 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SSX6Q7RTT6 188 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 CHST6Q9GZX3 395 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.24□□□□□ -0.93
COPB2-211ENST00000513274 TCF19Q9Y242 345 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms