RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CD177Q8N6Q3 437 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF596Q8TC21 504 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HPSE2Q8WWQ2 592 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DDB2Q92466 427 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RAX2Q96IS3 184 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CMTM6Q9NX76 183 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DPM3Q9P2X0 92 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 hADV38S2A0JD32 116 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DHRS12A0PJE2 317 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LEUTXA8MZ59 168 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 B2RBV5 119 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PSMD9O00233 223 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NME4O00746 187 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A17O43808 307 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 H2BFMP0C1H6 154 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM106CPP0CH98 169 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 T-ENOLP0DO92 83 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ACKR3P25106 362 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 IFNGR2P38484 337 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DLX6P56179 175 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LIPEQ05469 1076 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 EDDM3AQ14507 147 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN26Q16670 478 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DEFB136Q30KP8 78 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 KLHL12Q53G59 568 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PLCXD3Q63HM9 321 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TEX38Q6PEX7 206 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 C16orf89Q6UX73 402 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 COMMD2Q86X83 199 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PGAM4Q8N0Y7 254 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 POC1AQ8NBT0 407 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 IL17DQ8TAD2 202 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 AQP3Q92482 292 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RNFT2Q96EX2 444 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 GON7Q9BXV9 100 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR51I2Q9H344 312 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NDE1Q9NXR1 346 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CD300AQ9UGN4 299 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SCOCQ9UIL1 159 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A13Q9Y226 551 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.86□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 J3QT63 122 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 K7N7A8 449 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LDLRAD4O15165 306 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 AMY1AP04745 511 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 AMY2AP04746 511 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 IFNA6P05013 189 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HCKP08631 526 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RHCEP18577 417 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MAP2K3P46734 347 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HAAOP46952 286 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 VEGFCP49767 419 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 BLVRAP53004 296 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SMIM11AP58511 58 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HES1Q14469 280 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR52W1Q6IF63 320 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MOB3CQ70IA8 216 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SLC35E3Q7Z769 313 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 KRT77Q7Z794 578 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF573Q86YE8 665 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DEFB107AQ8IZN7 70 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LINC00471Q8N535 108 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DRAM1Q8N682 238 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RNF148Q8N7C7 305 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF511Q8NB15 262 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR52J3Q8NH60 311 aa4.85□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms