RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 FOXO1Q12778 655 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PP6455Q8WZ26 134 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 REEP6Q96HR9 211 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 LRFN1Q9P244 771 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 MPTX1A8MV57 137 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TBPP20226 339 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GLRA1P23415 457 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SERPINF1P36955 418 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZNF345Q14585 488 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RAB35Q15286 201 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TAAR9Q96RI9 348 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 S100A13Q99584 98 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GPR132Q9UNW8 380 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR3A2P47893 321 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 HTR5AP47898 357 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 C9orf135Q5VTT2 229 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 BRICD5Q6PL45 260 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TMEM17Q86X19 198 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SKA3Q8IX90 412 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FOXB1Q99853 325 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SPRY4Q9C004 299 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 LOC400499M0QZD8 3231 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TMEM218A2RU14 115 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 MSTNO14793 375 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ADAP1O75689 374 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CST2P09228 141 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TREM1Q9NP99 234 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 EHFQ9NZC4 300 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZNF205O95201 554 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PGAM2P15259 253 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 HLA-GP17693 338 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ALDH3B1P43353 468 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GFRA1P56159 465 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TAF9Q16594 264 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DRAM2Q6UX65 266 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZSR3 168 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 STRADBQ9C0K7 418 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GPR35Q9HC97 309 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR6C6A6NF89 314 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DNPH1O43598 174 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 BATF2Q8N1L9 274 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TMED6Q8WW62 240 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DCUN1D4Q92564 292 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DYRK2Q92630 601 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAM117AQ9C073 453 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DBX1A6NMT0 343 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAM166BA8MTA8 275 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 NEURL1O76050 574 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 APOC1P02654 83 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PSMB6P28072 239 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RRADP55042 308 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PDCD1Q15116 288 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TM2D1Q9BX74 207 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms