RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491339.1

GABRE-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 2,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-211ENST00000491339 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 HAAOP46952 286 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CAV3P56539 151 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 ZNF91Q05481 1191 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 RAB40BQ12829 278 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 TMEM86BQ8N661 226 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 POC1AQ8NBT0 407 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 AQP3Q92482 292 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 RNFT2Q96EX2 444 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 AMBNQ9NP70 447 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 GPR173Q9NS66 373 aa7.16□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 SCN3BQ9NY72 215 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 DUX4Q9UBX2 424 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 GNG8Q9UK08 70 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.16□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 NXPH2O95156 264 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 APOL3O95236 402 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CCDC159P0C7I6 412 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CCL1P22362 96 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 TGM4P49221 684 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 ACTA2P62736 377 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 ACTG2P63267 376 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 KLHL22Q53GT1 634 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 SSX6Q7RTT6 188 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.16□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 SEH1LQ96EE3 360 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.16□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.16□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.15□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 SERPINA3P01011 423 aa7.15□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 FBP1P09467 338 aa7.15□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.15□□□□□ -1.26
GABRE-211ENST00000491339 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.15□□□□□ -1.26
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GABRE-211ENST00000491339 XPNPEP2O43895 674 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PAHP00439 452 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 MELTFP08582 738 aa7.15□□□□□ -1.27
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GABRE-211ENST00000491339 PSG2P11465 335 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SELLP14151 372 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 ZNF20P17024 532 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DCKP27707 260 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 DGUOKQ16854 277 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 TP53I3Q53FA7 332 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 Q6YL49 198 aa7.15□□□□□ -1.27
GABRE-211ENST00000491339 FGFRL1Q8N441 504 aa7.15□□□□□ -1.27
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