RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 V9GYS6 101 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.25□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MEGF11A6BM72 1044 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 BTBD17A6NE02 478 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 A6NLC8 198 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DVL1O14640 695 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ISG15P05161 165 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MPZP25189 248 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GABRA5P31644 462 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ATP6V1E1P36543 226 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ACSM1Q08AH1 577 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 RAB40BQ12829 278 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 AANATQ16613 207 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MICBQ29980 383 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 STUMQ69YW2 141 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 WDR86Q86TI4 376 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF573Q86YE8 665 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SYS1Q8N2H4 156 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 Q8N7P7 452 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DTX3Q8N9I9 347 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 PP6455Q8WZ26 134 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MBOAT4Q96T53 435 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GPR84Q9NQS5 396 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 RASL12Q9NYN1 266 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.24□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1B0GTI1 187 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 IRGMA1A4Y4 181 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 J3QT63 122 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 M0R129 80 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 NPFFO15130 113 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 NRASP01111 189 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 GYPAP02724 150 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 UBE2E1P51965 193 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 HCCSP53701 268 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CAV3P56539 151 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF91Q05481 1191 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 IL18R1Q13478 541 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 TTC23Q5W5X9 447 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 COMMD2Q86X83 199 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC29Q8WV35 223 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 RORBQ92753 470 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 PHF21AQ96BD5 680 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MED30Q96HR3 178 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 APOL4Q9BPW4 351 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 PKIBQ9C010 78 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 CHST5Q9GZS9 411 aa6.23□□□□□ -1.41
RBBP4-211ENST00000477563 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms