RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM166AQ6J272 317 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GLCCI1Q86VQ1 547 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SAXO1Q8IYX7 474 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NKAIN3Q8N8D7 197 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR51A2Q8NGJ7 313 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 S100A13Q99584 98 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR13Q9H1Z4 485 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 RHOFQ9HBH0 211 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SMURF1Q9HCE7 757 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.19■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HIVEP1P15822 2718 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MEGF11A6BM72 1044 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR2AT4A6NND4 320 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TMPRSS2O15393 492 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LY6G6DO95868 133 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TGFAP01135 160 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NPY4RP50391 375 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 STUMQ69YW2 141 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ACP7Q6ZNF0 438 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR5D18Q8NGL1 313 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF488Q96MN9 340 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LPAR2Q9HBW0 351 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SNTG1Q9NSN8 517 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CLN8Q9UBY8 286 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR5V1Q9UGF6 321 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNS2Q9ULS6 477 aa18.18■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAV20A0A0B4J274 112 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM157AC9JC47 383 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 INMTO95050 263 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 WNT2P09544 360 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ASPHD2Q6ICH7 369 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 JAGN1Q8N5M9 183 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR52N4Q8NGI2 321 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ORAI1Q96D31 301 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MED30Q96HR3 178 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SMR3AQ99954 134 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 YAE1D1Q9NRH1 226 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GLS2Q9UI32 602 aa18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 F8P00451 2351 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 KNG1P01042 644 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MAS1P04201 325 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GABRA2P47869 451 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 BMXP51813 675 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LYPD2Q6UXB3 125 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CDH26Q8IXH8 852 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 OR5T2Q8NGG2 359 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 MTCH1Q9NZJ7 389 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 KAAG1Q9UBP8 84 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 GABRPO00591 440 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 NDUFB3O43676 98 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ANGPTL7O43827 346 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SC5DO75845 299 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 UCHL1P09936 223 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVK11-1P61568 191 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 IL13RA1P78552 427 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LCN2P80188 198 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 INSL4Q14641 139 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SSX1Q16384 188 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC10Q5BKY1 277 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 BATF2Q8N1L9 274 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PXT1Q8NFP0 134 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM186Q96B77 213 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SEH1LQ96EE3 360 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 CCL13Q99616 98 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 HES4Q9HCC6 221 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-212ENST00000472427 A8MV72 311 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 A8MXK9 166 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PIN1P1O15428 100 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 KDM4BO94953 1096 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PSG2P11465 335 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKACAP17612 351 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SRMP19623 302 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 BCL3P20749 454 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 GALP22466 123 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 ZP1P60852 638 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 FABP5Q01469 135 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 RSU1Q15404 277 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 CD276Q5ZPR3 534 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM58AQ8N1B3 248 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms