RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 AHSA2Q719I0 299 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OR5D14Q8NGL3 314 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OR13C3Q8NGS6 347 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 C8orf46Q8TAG6 207 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GPR148Q8TDV2 347 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GATAD2BQ8WXI9 593 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MYDGFQ969H8 173 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 UPRTQ96BW1 309 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SMIM19Q96E16 107 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OPALINQ96PE5 141 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SCN3BQ9NY72 215 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RAB26Q9ULW5 256 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TPRKBQ9Y3C4 175 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 AUP1Q9Y679 476 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.02□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NDUFB3O43676 98 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GPX5O75715 221 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 WNT4P56705 351 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IL13RA1P78552 427 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 BDH1Q02338 343 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IRF3Q14653 427 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 LRRC10Q5BKY1 277 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MKXQ8IYA7 352 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GHSRQ92847 366 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GAFA1Q96PS6 74 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MRI1Q9BV20 369 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DHDHQ9UQ10 334 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.01□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 A0A0A6YYJ9 748 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RFPL4AA6NLU0 287 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PTGES3LE9PB15 166 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SULT1B1O43704 296 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KNG1P01042 644 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ALDOBP05062 364 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CD2P06729 351 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PRDX2P32119 198 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MTCP1P56278 107 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PDZK1IP1Q13113 114 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GPR50Q13585 617 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DGUOKQ16854 277 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 YIF1BQ5BJH7 314 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ASPHD2Q6ICH7 369 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 Q8IYB0 196 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OR13C9Q8NGT0 318 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NPRL2Q8WTW4 380 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CEP19Q96LK0 163 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF488Q96MN9 340 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DCTN5Q9BTE1 182 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CNTD2Q9H8S5 307 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RHOFQ9HBH0 211 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 A0A1B0GW55 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF879B4DU55 563 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NXPH2O95156 264 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MMP9P14780 707 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CRHBPP24387 322 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 BPIFB3P59826 476 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 Q499Y3 187 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ASCL4Q6XD76 172 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 USP43Q70EL4 1123 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF561Q8N587 486 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CD177Q8N6Q3 437 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DUX4Q9UBX2 424 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms